越来越多的证据表明：自身免疫性机制可能是部分癫痫患者的病因。
自身抗体与多种形式的癫痫有关，包括Rasmussen脑炎中的抗谷氨酸盐抗体、Landau-Kleffner综合征中的抗脑细胞抗体、抗心磷脂抗体、红斑狼疮中的狼疮抗凝抗体以及十分罕见的男性刻板综合征中的抗谷氨酸脱羧酶抗体等。有文献报导：在未经选择的癫痫患者中，抗磷脂抗体、抗神经节苷脂抗体抗谷氨酸脱羧酶抗体等水平的升高均与癫痫有关。
研究人员认为，“血液中自身抗体与部分形式的癫痫发作可能有关，但有报导提出癫痫发作本身和抗癫痫药物可以改变患者机体的免疫反应。目前尚不清楚这些自身抗体与癫痫和抗癫痫治疗的因果关系。”他们指出，不同的癫痫患者对静脉免疫球蛋白和皮质醇激素的治疗可以出现戏剧性的反应，这一发现支持了这项研究的结论。
研究人员同时承认，“皮质醇激素的治疗反应不能充分证明免疫反应介导的致病机制，它可能是因治疗而使GABA 受体直接抑制的结果。反之，因自身免疫机制导致的中枢神经系统不可挽救的损伤可以使神经系统对免疫调节的反应缺失。”
“这项研究结论可以在将来帮助我们选择那些可以从免疫调节治疗中获益的癫痫患者，确定致病性自身抗体可以使患者在早期得到治疗、避免造成继发性损伤。”
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