肝穿刺是用穿刺器材的负压吸引原理，从肝脏中取出长约1厘米，细如发丝的肝组织作光学及电子显微镜检查(又叫肝活体组织检查)其意义如下；
(1)用于鉴别诊断：
病毒性肝炎患者有时必须与肝炎外其他疾病鉴别，有时即使用CT及磁共振也不易区分，此时应进行肝穿刺。有的症状体征不明显；有的黄疸深重，但症状不多，肝大明显；有的症状体征不明显但转氨酶持续升高；有的胎甲球检测滴度增高；有的为了观察药物确切疗效，都可考虑肝穿刺。有时对肝炎和不明原因的患者肝穿刺后，发现了肝硬变，脂肪肝、肝脓肿、肝结核、肝吸虫、肝淀粉样变性，肝肉芽肿，体质性肝功能不良，家族性非深血性黄疸、慢性特发性黄疸，甚至于肝癌等。可知肝穿刺是诊治中不可缺少的手段。
(2)鉴别黄疸性质原因：
肝穿刺还可在黄疸重时进行，可鉴别是肝细胞坏死、肝内胆汁淤积、肝寄生虫、肝脏肿瘤疾病。通过肝穿刺明确诊断，指导治疗与了解预后。
(3)鉴别肝炎临床类型：
慢性迁延性肝炎与慢性活动性肝炎轻型，两者在临床上难以分清，但预后不一样。慢性活动性肝炎与早期肝硬变也难以鉴别，前者适当治疗病变可逆转，而后者硬变的肝组织则难以逆转。暴发性肝功能衰竭的肝坏死型，大部分肝细胞死亡。如肝穿刺发现肝细胞是水肿变性则80%有可能救活，予后截然不同。穿刺很有必要。
(4)作为药效判断指标：
药物的效果(疗效)通过肝穿刺所提供的肝组织作为依据，可客观而且准确的予以反应。对于治疗极为有用。
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